Πρόσθετες πληροφορίες
Ανοιχτός διαγωνισμός στα πλαίσια του έργου INsPiRE - "INtegrating the Emerging Research Potential of the University of Athens Cancer Research Group in the European research area", Κ.Α. 11205, επιστημονικός υπεύθυνος: Καθ. Χρήστος Κίττας, Ιατρική Σχολή.
Πακέτο εργασίας 2: WP2 upgrading – acquiring research equipment (αναβάθμιση – προμήθεια εργαστηριακού εξοπλισμού).
Μέγιστο συνολικό κόστος: 920 000 EUR (δεν περιλαμβάνεται ΦΠΑ).
Τημήμα - part περιγραφή / description μέγιστο κόστος / max price.
1 Σύστημα ερευνητικού μικροσκοπίου για μικροτομές και απόσπαση βιολογικού υλικού με λέιζερ 180 000,00 EUR.
2 Αναβάθμιση μικροσκοπίου TE2000S/ECLIPSE C-1 Nikon συνεστιακής μικροσκοπίας σάρωσης Laser 65 000,00 EUR.
3 Υπερμικροτόμος / κρυο-υπερμικροτόμος 138 000,00 EUR.
4 Αυτόματη συσκευή κρυο-αντικατάστασης 27 000,00 EUR.
5 Σύστημα γενετικών αναλύσεων ευρείας κλίμακας επόμενης γενιάς 140 000,00 EUR.
6 Αυτοματοποιημένος αλληλουχητής 40 000,00 EUR.
7 Κυτταρομετρητής ροής 150 000,00 EUR.
8 Πλήρες σύστημα παρασκευαστικής χρωματογραφίας αερίου υπερκρίσιμης θερμοκρασίας SFC για τον καθαρισμό και την ταυτοποίηση μορίων με πιθανή φαρμακευτική δράση 94 000,00 EUR.
9 Φυγοκεντρικός Συμπυκνωτής Υψηλής Απόδοσης 86 000,00 EUR
Σύνολο 920 000,00 EUR.
Προδιαγραφές.
1: Σύστημα ερευνητικού μικροσκοπίου για μικροτομές και απόσπαση βιολογικού υλικού με λέιζερ
Γενική περιγραφή.
Το σύστημα θα πρέπει να είναι αυτοματοποιημένο, υψηλής ακρίβειας, με αποφυγή επαφής του βιολογικού υλικού. Nα παρέχει δυνατότητα αποκοπής και απόσπασης περιοχών του παρασκευάσματος που εμφανίζουν ενδιαφέρον με λέιζερ και μεταφορά σε δοκιμαστικό σωλήνα σε συνθήκες υψηλής καθαρότητας δίχως (επι)μολύνσεις, για περαιτέρω πειραματική ανάλυση από τον ερευνητή.
Χρήσεις και εφαρμογές.
Α. Το σύστημα θα πρέπει τεκμηριωμένα (σε φυλλάδια της κατασκευάστριας εταιρείας ή/και σε διεθνείς δημοσιεύσεις) να δύναται να αποσπά:
1) υποκυτταρικά οργανίδια, όπως μονούς πυρήνες, μεταφασικά χρωμοσώματα ή τμήματά τους κ.α.
2) μονά κύτταρα
3) πολλαπλά κύτταρα ταυτόχρονα ή τμήματα ιστών διαφόρων μεγεθών και σχημάτων
Β. Το πρωτογενές υλικό θα πρέπει να μπορεί να προέρχεται από:
1) τομές από ιστούς μονιμοποιημένους και εγκλεισμένους σε παραφίνη
2) τομές από νωπούς ιστούς
3) ζωντανά κύτταρα από κυταροκαλλιέργεια ή ιστικές (πρωτογενής) καλλιέργειες
4) μεταφασικά χρωμοσώματα
5) επιχρίσματα
6) λεπτά (biofilm) επιχρίσματα
7) ιατροδικαστικά δείγματα
8) εμβρυολογικά παρασκευάσματα
9) μικροχειρισμοί δείγματος μέσω λέιζερ
10) και άλλα (ελεύθερα προς αναφορά)
Γ. Στη περίπτωση απόσπασης ζωντανών κυττάρων, είτε από καλλιέργεια ή από διαχείριση ζωντανών εμβρυολογικών παρασκευασμάτων, η βιωσιμότητα αλλά και ευρύτερα η ακεραιότητα αυτών πρέπει να εξασφαλίζεται δίχως καμία βλάβη ή παρενέργεια. Επίσης, όποια βιομόρια πρόκειται να απομονωθούν από αυτό το υλικό δεν θα πρέπει να έχουν υποστεί βλάβη.
Δ. Το όλο σύστημα θα πρέπει να είναι απλό και εύκολο στη χρήση, ελεγχόμενο από ηλεκτρονικό υπολογιστή και πλήρως συμβατό με αναλώσιμα/αντιδραστήρια πολλών εταιρειών για περεταίρω εφαρμογές όπως συλλογή του υλικού, απομόνωση νουκλεϊκών οξέων (DNA, RNA), πρωτεϊνών κ.α.
Ε. Το μικροσκόπιο του συστήματος να μπορεί να χρησιμοποιηθεί αυτόνομα και σαν κανονικό μικροσκόπιο έρευνας χωρίς καθόλου περιορισμούς στις τυπικές λειτουργίες παρατήρησης και λήψης εικόνας. Οι χρήσεις αυτές θα πρέπει να περιλαμβάνουν μικροσκοπίου φωτεινού πεδίου, αντιθέτου φάσεως, φθορισμού, επιφθορισμού, DIC.
Τεχνικά χαρακτηριστικά.
Τμήμα κοπής με λέιζερ.
1. Να διαθέτει UV πηγή λέιζερ σταθερής κατάστασης (frequency tripled solid state laser) με μήκος κύματος 355 nm χωρίς να επηρεάζει το DNA, το RNA και τις πρωτεΐνες.
2. Η πηγή να διαθέτει κατ’ ελάχιστο τα εξής χαρακτηριστικά:
— ενέργεια παλμού (pulse energy) > 90 μJ,
— διάρκεια παλμού (pulse duration) <2 nsec,
— συχνότητα παλμού (pulse frequency) max. 100 ανά δευτερόλεπτο.
O συχνότητα ελέγχου του παλμού (pulse frequency of laser control) από 1 έως 100Hz.
3. Το σύστημα κοπής πρέπει να διαθέτει ακρίβεια ≤1μm, χωρίς να προκαλεί βλάβες στους ιστούς, στα κύτταρα και τα βιομόρια.
4. Η κοπή και απόσπαση του δείγματος θα πρέπει να πραγματοποιείται σε απόλυτα άσηπτες συνθήκες, χωρίς καμιά μηχανική επαφή (non-contact method) και χωρίς κανένα κίνδυνο επιμόλυνσης.
5. Να δίδεται όμως η δυνατότητα τομής και απόσπασης δειγμάτων με μεγάλη επιφάνεια μέσω επαφής.
6. Να διαθέτει ελεγχόμενη ισχύ, προστασία των ματιών του χρήστη, αυτόματη λειτουργία εστίασης μέσω του λογισμικού (με διάμετρο μικρότερη από 0,6 μm) για μεγάλη ακρίβεια κοπής χωρίς να απαιτείται συνεχή βαθμονόμηση του λέιζερ και δυνατότητα αποθήκευσης των επιθυμητών ρυθμίσεων του εκάστοτε χειριστή, καθώς και δυνατότητα χειροκίνητης λειτουργίας του λέιζερ πχ μέσω ποδοδιακόπτη.
7. Να διαθέτει υψηλής πιστότητας ηλεκτροκίνητη τράπεζα σε άξονες x-y, με χειριστήριο (joystick) που επιτρέπει με ακρίβεια την στόχευση του κυττάρου ή των κυττάρων που επιλέγονται προς απόσπαση από το παρασκεύασμα, με εύρος κίνησης 114x76 mm, ταχύτητα <50 mm/sec και ακρίβεια επανατοποθέτησης <1μm.
8. Η ηλεκτροκίνητη τράπεζα να επιδέχεται πολλαπλά κοινά πλακίδια, δισκία Petri για την περίπτωση εφαρμογών με ζωντανά κύτταρα, καθώς και πλήθος άλλων υποδοχέων παρασκευασμάτων.
9. Να διατίθεται με συγκρατητήρες (tube collectors) για χωρητικότητες 0.2 ml, 0.5 ml.
10. Η συλλογή κυττάρων ή/και απολύτως οριοθετημένων περιοχών του παρασκευάσματος (σε όλα τα γνωστά προς ανάλυση δείγματα, όπως σε Cryo ή Paraffin Preserved Tissues) να γίνεται άμεσα σε συλλέκτες έγκλισης και μεταφοράς του κυττάρου(ων) στόχου(ων) για την εύκολη και ασφαλή απομόνωση του γενετικού υλικού. Οι συλλέκτες αυτοί να είναι πώματα σωλήνων φυγοκέντρησης διαθέσιμα στο εμπόριο και εγγυώνται την αποφυγή επιμολύνσεων.
Τμήμα μικροσκοπίου.
1. Επιθυμητό το μικροσκόπιο να είναι ανάστροφο για να επιτελούνται οι χρήσεις και εφαρμογές που ζητούνται. Ο όρος το μικροσκόπιο να είναι ανάστροφο δεν είναι δεσμευτικός, αρκεί να πιστοποιείται η πλήρης δυνατότητα να επιτελούνται οι χρήσεις και εφαρμογές που ζητούνται.
2. Να διαθέτει σύστημα αυτόματου εστιασμού (motorized focus) με ακρίβεια περίπου 10 nm, που επιτρέπει στο χρήστη το σαφή μορφολογικό εντοπισμό σε επίπεδο κυττάρου-επί των παρασκευασμάτων με πλήρως αυτοματοποιημένες λειτουργίες μεγάλης ακρίβειας κατάλληλα οπτικά εξοπλισμένο για σύνδεση με το σύστημα μικροτομών μέσω λέιζερ.
3. Το ερευνητικό μικροσκόπιο με το οποίο θα λειτουργεί το σύστημα να είναι κατάλληλο για παρατηρήσεις σε φωτεινό πεδίο, φασική αντίθεση, ανοσοφθορισμό, και να έχει δυνατότητα επέκτασης σε άλλες τεχνικές όπως: Differential Interference Contrast (DIC), φασική αντίθεση (positive & negative phase contrast), Hoffmann Contrast, πόλωση, θερμαινόμενες τράπεζες, scanning τράπεζες, συστήματα micromanipulation και microinjection, σύστημα επωαστικού θαλάμου, Τotal Internal Reflection Fluoresence (TIRF), διάφορα συστήματα Video-Κάμερας, μικροφωτογράφησης, ανάλυσης της εικόνας μέσω Η/Υ, κ.α.
4. Να διαθέτει αυτοματοποιημένες κινήσεις, με TFT οθόνη για χειρισμό και έλεγχο των λειτουργιών του μικροσκοπίου, επίσης και για ειδική χρήση με επωαστικό θάλαμο (incubator), για τις παρακάτω λειτουργίες: αυτόματη εστίαση z-axis, ρύθμιση φωτισμού, αυτόματη κίνηση αντικειμενικών φακών, σύστημα πρόσθετων μεγεθύνσεων, ρύθμιση πυκνωτή, σύστημα αλλαγής της δέσμης φωτός, ανακλαστήρων με τα φίλτρα φθορισμού, ιριδοδιαφραγμάτων, οπτκών φίλτρων κ.α.
5. Να διαθέτει οπτικό εξοπλισμό με αντικειμενικούς φακούς υψηλής διακριτικής ικανότητας και ανάλυσης. Οι φακοί να είναι κατάλληλοι για μεγάλης απόστασης εργασία (LD), για λέιζερ μικροσκοπία: 5x/0.25 - 10x/0.50 – LD 20x/0.40 – LD 40x/0.60 – LD 63x/0.75, προσοφθάλμιους φακούς 10x με εύρος πεδίου τουλάχιστον 23mm, και πυκνωτή με μεγάλο αριθμητικό άνοιγμα (numerical aperture) κατάλληλο για φωτεινό πεδίο, φασική αντίθεση, σκοτεινό πεδίο και DIC.
6. Να διαθέτει πλήρες σύστημα ψυχρού φθορισμού με πηγή ψυχρού φωτισμού ισxύος 120W. Η οπτική δέσμη του φθορισμού να διαθέτει αποχρωματική διόρθωση για καλύτερη λήψη σημάτων. Να συνοδεύεται από σετ φίλτρων τουλάχιστον για DAPI, FITC, GFP, Rhodamine κ.α.
7. Δυνατότητα αναβάθμισης του συστήματος για μικροχειρισμό του δείγματος μέσω λέιζερ (με έμφαση στις εφαρμογές εμβρυολογίας).
Τμήμα κάμερας.
1. Να συνοδεύεται από υψηλής ευκρίνειας έγχρωμη κάμερα μικροσκοπίας CCD-camera μέσω της οποίας να προβάλλεται ζωντανά σε έγχρωμη οθόνη η όλη διαδικασία παρατήρηση-στόχευση-αποκοπή-συλλογή.
2. Η ψηφιακή κάμερα μικροσκοπίας να είναι ψυχόμενη μονοχρωματική με αισθητήρα CCD 2/3'' και ελάχιστη ανάλυση 1.4 megapixels, με χρόνους έκθεσης τουλάχιστον έως 20sec για παρατήρηση σε δείγματα φθορισμού με χαμηλή ένταση, με προβολή σε πραγματικό χρόνο με πολύ γρήγορο αισθητήρα (τουλάχιστον 20 fps σε μεγίστη ανάλυση), με ενσωματωμένο φίλτρο IR, με προσορμογέα C-mount, με ψηφιακή θύρα FireWire (ΙΕΕΕ1394a 400MBits/s), δυναμικό εύρος >2.200:1, ψηφιοποίηση 12 Bit / 24.57ΜΗz και μέγεθος pixel 6.45 μm x 6.45 μm.
3. Η κάμερα να είναι συνδεδεμένη με σύστημα καταγραφής, αποθήκευσης και αναπαραγωγής της εικόνας και να παρακολουθούνται σε πραγματικό χρόνο τα στιγμιότυπα της διαδικασίας αποκοπής/συλλογής και αποθηκεύονται στη μνήμη του Η/Υ, για την επανεξέταση όλης της διαδικασίας όταν επιθυμεί ο χρήστης.
Τμήμα Η/Υ και λογισμικό.
1. Το σύστημα να συνοδεύεται από ολοκληρωμένο σύστημα Η/Υ τελευταίας τεχνολογίας με τετραπύρηνο επεξεργαστή. Η εμφάνιση της διαδικασίας να παρατηρείται μέσα από επίπεδη οθόνη (LCD) με ελάχιστη διαγώνιο 22’’.
2. Να παρέχεται η δυνατότητα άμεσης και αυτόματης απεικόνισης (χαρτογράφησης) ολόκληρου του παρασκευάσματος σε ελάχιστο χρόνο από τη στιγμή της εκκίνησης της διαδικασίας, με δυνατότητα οριοθέτησης της υπό παρατήρηση και μελέτη περιοχής σε σχέση με τη συνολική επιφάνεια του πλακιδίου για τον εύκολο και άνετο επαναπροσδιορισμό περιοχής προηγούμενης μελέτης για επανεκτίμηση.
3. Να υπάρχει δυνατότητα αυτόματης σάρωσης και αποθήκευσης όλης της εικόνας του πλακιδίου στο σκληρό δίσκο, διατηρώντας όλες τις πληροφορίες (ιστορικό) και ενέργειες του χρήστη (εκτομές, σχεδίαση περιοχών).
4. Να παρέχεται η δυνατότητα εντοπισμού και επιλογής διαφορετικών περιοχών επί των παρασκευασμάτων που στη συνέχεια απομονώνονται ταυτόχρονα και αυτόματα.
5. Δυνατότητα αυτόματης κοπής πολλαπλών οριοθετημένων περιοχών, με τη χρήση του λέιζερ.
6. Δυνατότητα αποθήκευσης και ανάκλησης ιδιοτήτων (settings) για κάθε συσκευή του συστήματος όπως η τράπεζα, η κάμερα και η πηγή λέιζερ.
7. Στο διατιθέμενο πακέτο λογισμικού να περιέχεται πρόγραμμα επεξεργασίας εικόνας με διάφορα εργαλεία για την σημείωση σχολιασμό μικρών ή μεγάλων περιοχών ενδιαφέροντος κάθε σχήματος.
8. Να διαθέτει κατάλληλο λογισμικό φθορισμού multichannel και να έχει δυνατότητα μελλοντικής αναβάθμισης του λογισμικού και σε άλλες εφαρμογές.
Γενικά προαπαιτούμενα.
1. Το σύστημα θα πρέπει να υποστηρίζεται μέσω του αντιπροσώπου της εταιρείας στην Ελλάδα (αποδεδειγμένα με πιστοποιητικά εκπαίδευσης) καθώς και από τον κατασκευαστικό οίκο μέσω υπηρεσίας συνεχούς υποστήριξης πελατών – on line support.
2. Δωρεάν τρίμηνη εκπαίδευση και υποστήριξη στη χρήση του συστήματος.
3. Αντικραδασμική βάση για την τοποθέτηση του μικροσκοπίου.
4. Παροχή βιβλιογραφικής υποστήριξης και πρωτόκολλα για χρήσεις και εφαρμογές του συστήματος.
Μέγιστη τιμή: € 180.000.
2: Αναβάθμιση μικροσκοπίου TE2000S/ECLIPSE C-1 Nikon συνεστιακής μικροσκοπίας σάρωσης laser
Προσθήκη ενός επιπλέον Laser (διέργεση στα 408 nm, Ex408) το οποίο θα συνοδεύεται από τη κατάλληλη DM μονάδα laser (laser module), μονάδες ανίχνευσης (detection units) με τους συνδέσμους και φίλτρα ανάσχεσης (filter blocks) για τρεις φωτοπολλαπλασιαστές (photomultipliers, PMTs), διχρωϊκά κάτοπτρα (dichroic mirrors) και φίλτρα φραγμού (filter barriers), οπτικά συστήματα αντίθεσης φάσης και φθορισμού (Φακοί 100x Fluo, 40x Fluo/Phase, 100x Phase) υψηλής διακριτικής ικανότητας και ανάλυσης, καθώς και σύστημα θερμαινόμενης γυάλινης πλάκας με το τροφοδοτικό της για μικροσκοπία χρονικής ακολουθίας (time-lapse) ζωντανών κυττάρων. Με τρία (3) χρόνια εγγύηση καλής λειτουργίας και τεχνικής υποστήριξης.
Μέγιστη τιμή: 65 000 EUR.
3: Υπερμικροτόμος / κρυο-υπερμικροτόμος
Χειροκίνητη ή αυτόματη εργασία για κοπή εγκλεισμένου ιστού από 1-15.000 nm (τα βήματα εξαρτώνται από το πάχος του ιστού) με ρυθμιζόμενη ταχύτητα κοπής έως 100 mm/sec (σε βήματα των 0,1 mm/sec). Ο μικροτόμος να έχει ταχύτητα επιστροφής: 10,30,50 mm/sec με βηματικό έλεγχο 0,1-15 μm (βήματα). Να χρησιμοποιεί ως τρόπο κοπής του ιστού τη δύναμη της βαρύτητας (κάθετη κίνηση του δείγματος με τη βαρύτητα). Να χρησιμοποιεί και γυάλινα και αδαμάντινα μαχαίρια και να χρησιμοποιείται και από αριστερόχειρες και από δεξιόχειρες χρήστες. Θα πρέπει να ελέγχεται από οθόνη επαφής, να έχει εργονομικό στερεοσκόπιο με ευκεντρική κίνηση του υποδοχέα του στερεοσκοπίου (+5ο/-8ο) για καλύτερη παρατήρηση του μαχαιριού και του δείγματος, ρυθμιζόμενους προσοφθάλμιους και δυνατότητα σύνδεσης με κάμερα. Ενσωματωμένο αντι-κραδασμικό σύστημα και ειδική αντικραδασμική τράπεζα. Απόσταση εργασίας: 110 MM. Κίνηση του υποδοχέα μαχαιριού με μοτέρ και προσανατολισμός του μαχαιριού με rocking mode για το κούρεμα (trimming) του μπλοκ της ρητίνης, φωτισμός του δείγματος 3 τύπων με LED (όχι φθορισμό ή αλογόνο), με ρυθμιζόμενη φωτεινότητα και προσανατολισμό του δείγματος και δυνατότητα να δεχθεί διάφορους υποδοχείς και από παλαιότερους υπερμικροτόμους. Να είναι εφοδιασμένη με κρυο-θάλαμο με ρύθμιση της θερμοκρασίας του μαχαιριού, του δείγματος και του εσωτερικού χώρου. Η περιοχή θερμοκρασίας από –15οC έως –186oC. Με επιπλέον εξαρτήματα, όπως το δοχείο υγρού αζώτου Dewar (x2), για την άντληση του υγρού αζώτου και την αποθήκευση δειγμάτων, καθώς και αδαμάντινα μαχαίρια 25 mm πλάτους (x2), για τομές ξηρές/υγρές κρυοεργασίας. Με τρία (3) χρόνια εγγύηση καλής λειτουργίας και τεχνικής υποστήριξης.
Μέγιστη τιμή: 138 000 EUR.
4: Αυτόματη συσκευή κρυο-αντικατάστασης
Να είναι εφοδιασμένη με φορητή συσκευή για κρυο-αντικατάσταση των δειγμάτων σε κάθε μέσον κρυο-αντικατάστασης, διαπότισης με ρητίνη και πολυμερισμού με LED (όχι με συμβατή λυχνία UV), ελεγχόμενη από μικροϋπολογιστή, με παρακολούθηση και προγραμματισμό μέσω έγχρωμης LCD οθόνης και ποντίκι. Περιοχή θερμοκρασίας/χρόνου (-140οC έως 70οC) και μηχανισμοί βαθειάς ψύξης έως 10 ώρες. Ενσωματωμένη μνήμη με 10 χρήστες και 99 προγράμματα για κάθε χρήστη και 99 βήματα σε κάθε πρόγραμμα και είσοδο USB για φόρτωση όλων των δεδομένων. Να είναι εξοπλισμένη με δοχείο Dewar υγρού αζώτου, το οποίο να είναι αρκετά μεγάλο για πρωτόκολλο 5 ημερών, με σύστημα για αυτόματη διαχείριση όλων των αντιδραστηρίων που χρειάζονται (ένα βήμα προετοιμασία, απάλειψη λαθών χειριστή, προστασία δείγματος και χρήσης, επαναλήψιμα αποτελέσματα). Πλήρως αυτόματη διαχείριση των αντιδραστηρίων που χρειάζονται. Ρυθμιζόμενη ροή αερίου για απομάκρυνση υγρασίας και οξυγόνου από την περιοχή εργασίας. Πλατφόρμα εργασίας από ανοξείδωτο χάλυβα και ενσωματωμένο φωτισμό LED για ορατότητα του δείγματος με σύστημα απαγωγής ατμών. Με τρία (3) χρόνια εγγύηση καλής λειτουργίας και τεχνικής υποστήριξης.
Μέγιστη τιμή: 27 000 EUR.
5: Σύστημα γενετικών αναλύσεων ευρείας κλίμακας επόμενης γενιάς
Απαραίτητες τεχνικές προδιαγραφές:
5.1. Πλατφόρμα - γενικά.
— Το σύστημα νουκλεοτιδικής αλληλούχησης επόμενης γενιάς [next-generation sequencing (NGS) system] πρέπει να είναι ευέλικτο, χαμηλού κόστους, και συμβατό με πολλαπλές εφαρμογές. Μεταξύ των εφαρμογών, θα πρέπει να περιλαμβάνονται τα παρακάτω: αλληλούχηση μικρών σε μέγεθος γονιδιωμάτων, προϊόντων αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR), αλληλούχηση μορίων RNA και ειδικότερα μικρομορικακών μορίων RNA (miRNA), αλληλούχηση συζευγμένων άκρων (paired-end sequencing), αλληλούχηση κατόπιν ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης (ChIP-seq), και προσδιορισμός αριθμού αντιγράφων,
— Το σύστημα NGS πρέπει να επιτρέπει την ταυτόχρονη αλληλούχηση πολλαπλών δειγμάτων με τη χρήση ειδικών κωδικών αναγνώρισης (barcodes), καθώς και δυνατότητα αλληλούχησης με υψηλή ακρίβεια και κλιμακωτή απόδοση, η οποία πρέπει να κυμαίνεται και να φτάνει έως τουλάχιστον 1 δισεκατομμύριο βάσεις (1Gb),
— Η λειτουργία του συστήματος NGS πρέπει να είναι αξιόπιστη και εύχρηστη, και η συντήρησή του πρέπει να είναι εύκολη και χαμηλού κόστους για τον προσδιορισμό της αλληλουχίας πολυνουκλεοτιδίων διαφόρων μεγεθών,
— Η χημεία του συστήματος NGS πρέπει να επιτρέπει απλή ανάγνωση τμημάτων μήκους τουλάχιστον 200 νουκλεοτιδίων,
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από κατάλληλο ηλεκτρονικό υπολογιστή και αντίστοιχο λογισμικό, κατάλληλο για πρωτογενή ανάλυση δεδομένων αλληλούχησης.
5.2. Λογισμικό
— Ο ηλεκτρονικός υπολογιστής πρέπει να περιλαμβάνει, εκτός των άλλων, λογισμικό για δευτερογενή ανάλυση των αποτελεσμάτων αλληλούχησης, καθώς και όλα τα απαραίτητα υπολογιστικά εργαλεία για την ανάλυση, σύγκριση, και σύνθεση των δεδομένων που παράγονται από τις εφαρμογές αλληλούχησης που αναφέρονται αναλυτικά στην παράγραφο 1.1,
— Το λογισμικό πρέπει να συνοδεύεται από άδεια χρήστη, διάρκειας τουλάχιστον 3 ετών,
— Στα πλαίσια της αλληλούχησης DNA, η υπολογιστική ανάλυση πρέπει να έχει τη δυνατότητα να επεκταθεί ώστε να αποκαλύψει ποικιλομορφίες στο DNA, πέρα από τα απλά φίλτρα με βάση τη σε συχνότητα αλληλόμορφων και το βαθμό επικάλυψης,
— Το λογισμικό πρέπει να εκτελεί στατιστικό έλεγχο ανά μια βάση ξεχωριστά, ώστε να διαπιστώνει αν η οποιαδήποτε διαφοροποίηση που θα εμφανίζεται σε αυτή τη βάση είναι στατιστικά σημαντική σε σχέση με το δείγμα ελέγχου,
— Το λογισμικό πρέπει να επιτρέπει συγκρίσεις δυαδικού χαρακτήρα, όπου ένα δείγμα συγκρίνεται με ένα δείγμα ελέγχου, ή και μεταξύ πολλαπλών δειγμάτων που δεν περιλαμβάνουν συγκεκριμένο δείγμα αναφοράς.
5.3. Συσκευές προετοιμασίας δείγματος για αλληλούχηση
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από αυτοματοποιημένο σύστημα προετοιμασίας εκμαγείων προς αλληλούχηση, που να επιτρέπει την αξιόπιστη και επαναλήψιμη προετοιμασία εκμαγείων, να απλουστεύει τη ροή εργασίας της διαδικασίας αλληλούχησης, να αποφέρει σημαντική εξοικονόμηση χρόνου, και να αυξάνει συνολικά την αποδοτικότητα της αλληλούχησης,
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από σύστημα προετοιμασίας βιβλιοθηκών προς ενίσχυση, το οποίο θα δίνει τη δυνατότητα στο χρήστη να προσαρμόσει ο ίδιος τις διάφορες μεταβλητές προς βελτιστοποίηση των σχετικών πρωτοκόλλων,
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από κατάλληλο σύστημα ενίσχυσης των προπαρασκευασμένων γενετικών βιβλιοθηκών, με θερμαινόμενη πλάκα 96 θέσεων, η οποία να είναι πολύ ανθεκτική έναντι της διάβρωσης και να έχει μέσο ρυθμό ανύψωσης θερμοκρασίας τουλάχιστον 5ºC/sec και μέσο ρυθμό πτώσης θερμοκρασίας τουλάχιστον 4.5ºC/sec, εσωτερική βαθμονόμηση τουλάχιστον από 4º έως 99ºC, και δυνατότητα επανέκκινησης της αντίδρασης ενίσχυσης μετά από διακοπή και ακόλουθη επαναφορά του ηλεκτρικού ρεύματος που τροφοδοτεί τη συσκευή,
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από κατάλληλo εξοπλισμό για το διαχωρισμό των θραυσμάτων της γενετικής βιβλιοθήκης και την επιλεκτική συλλογή τους.
5.4. Θερμικός κυκλοποιητής
— Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από έναν συμβατό θερμικό κυκλοποιητή για την ποσοτικοποίηση γενετικής βιβλιοθήκης, με τη μέγιστη δυνατή απόδοση στον ελάχιστο δυνατό χρόνο,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να έχει τη δυνατότητα να πραγματοποιεί αναλύσεις ποσοτικής PCR σε πραγματικό χρόνο και ανάλυση τελικού σημείου,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να είναι πλήρως βελτιστοποιημένος για γρήγορη κυκλοποίηση και να δίνει αξιόπιστα αποτελέσματα, σε ποσότητα του ορίου ανίχνευσής του, σε λιγότερο από 45 λεπτά,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να περιλαμβάνει μια ταχέως θερμαινόμενη πλάκα που να εξασφαλίζει θερμική ομοιομορφία με τη μέγιστη ταχύτητα και με γρήγορο ρυθμό ανύψωσης και πτώσης της θερμοκρασίας, ώστε να επιτρέπει τάχιστα αποτελέσματα χωρίς να βλάπτεται η ποιότητα της ανάλυσης,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να επιτρέπει τη διεξαγωγή τουλάχιστον 96 αναλύσεων σε ένα πλακίδιο μικροτιτλοδότησης, με πολύ χαμηλό όγκο αντίδρασης (10μL),
— Το οπτικό σύστημά του πρέπει να περιλαμβάνει τουλάχιστον πέντε φίλτρα διέγερσης και τουλάχιστον πέντε φίλτρα εκπομπής,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να χαρακτηρίζεται από εξαιρετική ακρίβεια σε αντιδράσεις μικρού όγκου,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να βαθμονομηθεί κατά την εγκατάστασή του για τις υποστηριζόμενες φθορίζουσες χρωστικές,
— Ο θερμικός κυκλοποιητής πρέπει να συνοδεύεται από ηλεκτρονικό υπολογιστή και κατάλληλο λογισμικό, το οποίο θα παρέχει στο χρήστη τη δυνατότητα εκτέλεσης των μεθόδων ποσοτικοποίησης, την ανάλυση τήξης υψηλής διακριτικότητας, του σχεδιασμού εκκινητών καθώς και τη δυνατότητα να προσθέσει επιπλέον κύκλους κατά τη διάρκεια της αντίδρασης.
5.5. Συνοδευτικές συσκευές-υλικά, γενικοί όροι
6. Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από ένα φωτόμετρο ή φθορόμετρο, μεγάλης ευαισθησίας και ειδικότητας, για τον ποσοτικό προσδιορισμό νουκλεϊκών οξέων (δηλ. DNA και RNA). Το φωτόμετρο ή φθορόμετρο πρέπει να είναι κατάλληλο για μετρήσεις νανομοριακών ποσοτήτων νουκλεϊκών οξέων.
7. Το σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από συσκευή παραγωγής υπερκάθαρου νερού, κατάλληλου για χρήση στην πορεία της αλληλούχησης. Το νερό αυτό θα πρέπει να περιέχει ολικό οργανικό άνθρακα (TOC) όχι πάνω από 5 μέρη ανά εκατομμύριο (ppb) και να έχει ειδική αντίσταση στους 25οC μεγαλύτερη των 18 ΜΩ*cm. H συσκευή παραγωγής υπερκάθαρου νερού θα πρέπει να συνοδεύεται από 1 πλήρες σετ ανταλλακτικών.
8. Όλα τα μέρη του ολοκληρωμένου συστήματος NGS πρέπει να συνοδεύονται από εγγύηση τουλάχιστον 3 ετών και υποστήριξη με αντικατάσταση ανταλλακτικών για τουλάχιστον 7 έτη. Ο προμηθευτής θα εγγυάται την ύπαρξη ανταλλακτικών για τουλάχιστον δέκα χρόνια.
9. Όλα τα μέρη του ολοκληρωμένου συστήματος NGS πρέπει να λειτουργούν με τάση ρεύματος 220V.
10. Το ολοκληρωμένο σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από κατάλληλες συσκευές αδιάκοπης παροχής ρεύματος (UPS) για κάθε τμήμα του.
11. Ο προμηθευτής πρέπει να αναλάβει την πλήρη ευθύνη για την εγκατάσταση του μηχανήματος, την εκπαίδευση του προσωπικού, καθώς και την τεχνική και λειτουργική υποστήριξη.
12. Εκτός από τον κύριο εξοπλισμό, το ολοκληρωμένο σύστημα NGS πρέπει να συνοδεύεται από όλα τα kits που είναι απαραίτητα για τις διάφορες βαθμονομήσεις. Θα συνοδεύεται επίσης και από 1 kit ανά μεθοδολογία προκειμένου να διακριβωθεί η αξιόπιστη λειτουργία όλων των συσκευών του σε όλες εκείνες τις εφαρμογές που σύμφωνα με τις τεχνικές προδιαγραφές υποστηρίζουν.
13. Η προσφορά πρέπει να συνοδεύεται από ενδεικτικό υπολογισμό (βάση καταλόγου ή προσφοράς για τουλάχιστον 3 έτη) συνολικού κόστους ανά πείραμα αλληλούχησης πολυνουκλεοτιδίων διαφόρων μεγεθών (συνολικό μήκος αλληλουχίας ανά πείραμα: 5, 10, 50, 80, 100 και 1000 Κb). Ο προμηθευτής θα πρέπει να δεσμευτεί ότι θα προσφέρονται ίσες ή χαμηλότερες οι τιμές των αντιδραστηρίων που χρησιμοποιήθηκαν στον παραπάνω υπολογισμό για τουλάχιστον 3 έτη.
14. Οι τιμές που θα υπολογιστούν για την ανάλυση των διαφόρων μηκών αλληλουχιών ανά πείραμα και ιδιαίτερα εκείνων (5-50Κb) που αποτελούν και το σύνηθες υλικό προσδιορισμού στο προοριζόμενο εργαστήριο θα αποτελέσουν σημαντικό στοιχείο αξιολόγησης για την επιλογή του συστήματος.
15. Ο προμηθευτής πρέπει να παράσχει λίστα επιστημονικών δημοσιεύσεων που να αναφέρουν τη χρήση του προσφερόμενου μηχανήματος και των εφαρμογών του, καθώς και έτοιμα πρωτόκολλα για τις εφαρμογές NGS που αναφέρθηκαν στην παράγραφο 1.1. Θα πρέπει να καταθέσει φύλλο συμμόρφωσης όπου θα απαντώνται μια προς μια οι προδιαγραφές και θα τεκμηριώνονται σε παραπομπές στα επίσημα φυλλάδια. Πρέπει να παράσχει επίσης όλα τα φυλλάδια χρήσης καθώς και τα τεχνικά φυλλάδια τόσο της κυρίας πλατφόρμας όσο και των συνοδών συσκευών.
Μέγιστη τιμή: € 140.000.
6: Αυτοματοποιημένος αλληλουχητής
Απαραίτητα τεχνικά χαρακτηριστικά.
6.1. Αυτοματοποιημένος αλληλουχητής
— Ο αυτοματοποιημένος αλληλουχητής πρέπει να είναι ιδιαίτερα ευέλικτος, χαμηλού κόστους, και συμβατός με μια μεγάλη ποικιλία εφαρμογών, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης μεθυλίωσης,
— Η χημεία του αλληλουχητή και η τεχνολογία στην οποία βασίζεται η αντίδραση αλληλούχησης δεν πρέπει να απαιτεί ηλεκτροφόρηση ή χρήση ραδιενεργών ιχνηθετών,
— Η ενσωμάτωση κάθε νουκλεοτιδίου πρέπει να συνοδεύεται από σήμα φωτός το οποίο θα καταγράφεται από μια ευαίσθητη κάμερα ανίχνευσης φωτός και να παρουσιάζεται σε κατάλληλο γράφημα,
— Η πρώτη βάση μετά την αλληλουχία εκκινητή πρέπει να είναι το πρώτο σημείο δεδομένων στο γράφημα αλληλουχίας,
— Τα δεδομένα πρέπει να συλλέγονται και να αναπαρίστανται γραφικά σε πραγματικό χρόνο, επιτρέποντας έτσι στο χρήστη να παρακολουθεί την πρόοδο της αλληλούχησης,
— Η υψηλή πιστότητα της αλληλούχησης κατά τη σύνθεση, συζευγμένη με ένα κατάλληλο, εξελιγμένο λογισμικό σύστημα ανάλυσης, πρέπει να επιτρέπει την ανίχνευση και την ποσοτικοποίηση πολλών τύπων γενετικών παραλλαγών,
— Ο τύπος των ανιχνεύσιμων και ποσοτικοποιήσιμων γενετικών παραλλαγών πρέπει να είναι ευρύτατος, περιλαμβάνοντας πολύπλοκες μεταλλαγές με περισσότερες από μια παραλλαγές στην υπό ανάλυση περιοχή, σημειακές μεταλλαγές, προσθήκες/ελλείψεις, σημειακούς νουκλεοτιδικούς πολυμορφισμούς, δι-, τρι-, και τετραπολυμορφισμούς, και μικρές συνεχόμενες επαναλήψεις,
— Ο αυτοματοποιημένος αλληλουχητής πρέπει επίσης να επιτρέπει την ανίχνευση παραλλαγών αλληλουχίας που βρίσκονται σε ποσοστό συχνότητας ακόμα και 5 %,
— Κάθε αντίδραση πρέπει να μπορεί να μεταχειριστεί ως ξεχωριστή δοκιμασία, επιτρέποντας έτσι την εκτέλεση τουλάχιστον 20 διαφορετικών δοκιμασιών μέσα σε χρόνο μικρότερο από 2 ώρες,
— Ο αυτοματοποιημένος αλληλουχητής πρέπει να επιτρέπει την ανίχνευση και την ποσοτικοποίηση δύο ή περισσότερων τύπων γενετικών παραλλαγών ευρισκόμενων στην ίδια στοχευμένη περιοχή, καθώς επίσης να επιτρέπει τη χρήση ελέγχου ποιότητας,
— Ο αυτοματοποιημένος αλληλουχητής πρέπει να συνοδεύεται από πλήρως συμβατό ηλεκτρονικό υπολογιστή (desktop PC), κατάλληλο λογισμικό πακέτο με την αντίστοιχη άδεια χρήστη, και αναλυτικές οδηγίες χρήσης του,
— Τα δεδομένα που θα παράγονται από την αλληλούχηση πρέπει να επιτρέπουν την ανάλυση σε οποιονδήποτε συνδεδεμένο μέσω δικτύου υπολογιστή.
6.2. Συνοδευτικές συσκευές-υλικά, γενικοί όροι
— Ο αυτοματοποιημένος αλληλουχητής πρέπει να συνοδεύεται από μια κατάλληλη συσκευή για την παράλληλη προετοιμασία προς αλληλούχηση τουλάχιστον 20 προϊόντων PCR,
— Όλα τα μέρη του ολοκληρωμένου συστήματος NGS πρέπει να συνοδεύονται από εγγύηση τουλάχιστον 3 ετών και υποστήριξη με αντικατάσταση ανταλλακτικών για τουλάχιστον 7 έτη. Ο προμηθευτής θα εγγυάται την ύπαρξη ανταλλακτικών για τουλάχιστον δέκα χρόνια,
— Όλα τα μέρη του πρέπει να λειτουργούν με τάση ρεύματος 220V,
— Πρέπει να συνοδεύεται από κατάλληλη συσκευή αδιάκοπης παροχής ρεύματος (UPS),
— Ο προμηθευτής πρέπει να αναλάβει την πλήρη ευθύνη για την εγκατάσταση του μηχανήματος, την εκπαίδευση του προσωπικού, καθώς και την τεχνική και λειτουργική υποστήριξη. Πρέπει να παράσχει επίσης όλα τα φυλλάδια χρήσης καθώς και τα τεχνικά φυλλάδια,
— Ο αυτοματοποιημένου αλληλουχητής πρέπει να συνοδεύεται από όλα τα στοιχεία που είναι απαραίτητα για την έναρξη λειτουργίας, τη βαθμονόμηση και αρχική χρήση των πρωτοκόλλων των εφαρμογών που υποστηρίζονται από το σύστημα,
— Η σωστή λειτουργία του αυτοματοποιημένου αλληλουχητή πρέπει να πιστοποιηθεί χρησιμοποιώντας υλικά που θα παρασχεθούν από τον προμηθευτή.
Μέγιστη τιμή: 40 000 EUR.
7: Κυτταρομετρητής ροής
Γενικές προδιαγραφές.
1. O κυτταρομετρητής ροής να είναι πιστοποιημένος για χρήση διαγνωστικών/κλινικών εξετάσεων (CE-IVD marked βάση 98/79/EC).
2. Κάθε τεχνικό στοιχείο της προσφοράς να αποδεικνύεται με παραπομπές στα επίσημα φυλλάδια ή στην ιστοσελίδα της προσφέρουσας εταιρείας. Επίσης επιθυμητή είναι και βιβλιογραφία όπου θεωρείται απαραίτητη για την απόδειξη των προσφερομένων και την καλύτερη αξιολόγηση τους.
3. Να περιγραφούν οι δυνατές μελλοντικές αναβαθμίσεις του αναλυτή και να δοθούν τα τεχνικά στοιχεία αυτών.
4. Να πιστοποιείται με βιβλιογραφικές αναφορές η διαδεδομένη χρήση του προσφερόμενου οργάνου στον διεθνή κλινικό και ερευνητικό χώρο.
5. Να περιλαμβάνει, εκτός από την κυρίως συσκευή, αναλυτικές οδηγίες λειτουργίας, υπολογιστή κατάλληλα διαμορφωμένο, λογισμικό και εκτυπωτή, ώστε το σύστημα να είναι έτοιμο προς χρήση χωρίς ανάγκη αγοράς άλλου εξοπλισμού.
6. Nα υπάρχει η επιλογή για αναβάθμιση του κυτταρομετρητή με barcode reader. Nα δοθούν τα είδη των barcode που αναγνωρίζει.
7. Να αναφερθούν με παραπομπές στα φυλλάδια οι μηχανισμοί ασφαλείας για την προστασία του χρήστη.
8. Να κατατεθεί φύλλο συμμόρφωσης όπου θα απαντώνται μια προς μια οι προδιαγραφές και θα τεκμηριώνονται σε παραπομπές στα επίσημα φυλλάδια ή στην ιστοσελίδα της προσφέρουσας εταιρείας. Επίσης επιθυμητή είναι και η βιβλιογραφία όπου θεωρείται απαραίτητη, για την απόδειξη των προσφερομένων και την καλύτερη αξιολόγηση τους.
9. O κυτταρομετρητής ροής να διαθέτει 3 χρόνια εγγύηση
Προδιαγραφές κυρίως συσκευής.
1. Να διαθέτει τρία laser (405nm, 488nm και 633nm).
2. Η απόσταση μεταξύ των παραπάνω laser να είναι ικανή ώστε να παρέχεται η δυνατότητα ανάλυσης όσο το δυνατό περισσότερων φθοριοχρωμάτων ταυτόχρονα.
3. Προτιμάται οι πηγές laser να είναι σταθερές χωρίς ανάγκες ευθυγράμμισης.
4. Να μπορεί να αναλύει τις παρακάτω παραμέτρους: FSC, SSC και τουλάχιστον 8 φθορισμούς ταυτόχρονα σε γραμμική ή λογαριθμική μορφή.
5. Να διαθέτει σύγχρονη τεχνολογία και αρχιτεκτονική οπτικών (κατά προτίμηση επιλεκτικής αντανάκλασης) για την ανίχνευση του μέγιστου των φθορισμών και της ευαισθησίας. Να δοθούν αναλυτικά στοιχεία μέγιστης έντασης φθορισμού και ευαισθησίας.
6. Να διαθέτει την μεγαλύτερη δυνατή ευαισθησία, <200 MESF για όλους τους φθορισμούς.
7. Να διαθέτει κατάλληλο υδροδυναμικό σύστημα για την ελαχιστοποίηση της επιμόλυνσης των δειγμάτων <0.1 %.
8. Να μετρά μεμονωμένα σωληνάρια και να δύναται να φέρει φορέα πολλαπλών σωληναρίων (carousel) παράλληλα.
9. Να μπορεί να αναλύει μικρούς όγκους δειγμάτων (< 50μl) σε σωληνάρια.
10. Να μπορεί να πραγματοποιεί αντιστάθμιση της χρωματικής αλληλεπικάλυψης (compensation) ηλεκτρονικά κατά την διάρκεια της μέτρησης (online) ή/και μετά από αυτή (off-line).
11. Ο αναλυτής να πραγματοποιεί ανάλυση >6000 κύτταρα ανά δευτ/πτο.
12. Να έχει τη δυνατότητα ρύθμισης των φωτοπολλαπλασιαστών και της αντιστάθμισης της χρωματικής αλληλεπικάλυψης των φθοριοχρωμάτων που διεγείρονται από την ίδια ή διαφορετικές πηγές laser (inter και intra laser compensation) με ένα σωληνάριο.
13. Να δίνει τη δυνατότητα ρύθμισης πολυπαραμετρικού ουδού.
14. Να πραγματοποιεί αυτόματους κύκλους πλύσης και απολύμανσης κατά την έναρξη και κλείσιμο του αναλυτή και να διαθέτει αυτόματο τρόπο ελέγχου των φθορισμών που επιτελεί.
15. Ο αναλυτής να δύναται να φέρει σύστημα δειγματοληψίας από πλάκες μικροτιτλοδότησης 96 και 384 πηγαδιών.
16. Να μετρά τον απόλυτο αριθμό κυττάρων με δύο τρόπους: μέσω δεδομένων αιματολογικού αναλυτή και με αυτόματο πρόγραμμα που μετρά με πρώτυπα σφαιρίδα. Και οι δύο τρόποι να είναι πιστοποιημένοι βάσει των διεθνών κανονισμών π.χ CLSI και να διαθέτουν CE-IVD.
Προδιαγραφές κατασκευαστή.
1. Να έχει όσο δυνατό μεγαλύτερη εμπειρία στη διεθνή και ελληνική αγορά, που θα αντικατοπτρίζεται από τον αριθμό των εγκατεστημένων κυτταρομετρητών στη Ελληνική αγορά που θα διαθέτουν τουλάχιστον 2 laser.
2. Ο προμηθευτής να διαθέτει οργανωμένο τμήμα επιστημονικής και τεχνικής υποστήριξης και επίσης να έχει μακρόχρονη παρουσία στην Ελληνική αγορά της κυτταρομετρίας. Να κατατεθεί κατάσταση εγκατεστημένων αναλυτών σε ερευνητικά και κλινικά εργαστήρια και αποδεικτικά τεχνικής και επιστημονικής υποστήριξης.
3. Ο ανάδοχος να αναλάβει την εγκατάσταση του οργάνου και των παρελκόμενων του και τη διενέργεια σύντομης τεχνικής εκπαίδευσης του προσωπικού του εργαστηρίου όπου θα εγκατασταθεί. Ο ανάδοχος να αναλάβει την παροχή τεχνικής υποστήριξης και συμβουλών που αφορούν την εύρυθμη λειτουργία του οργάνου.
Προδιαγραφές παρελκόμενων.
1. Να συνοδεύεται από υπολογιστή υψηλής τεχνολογίας καθώς και έγχρωμο εκτυπωτή. Να περιγραφούν τα τεχνικά τους χαρακτηριστικά.
2. Το λογισμικό πρόγραμμα του αναλυτή να συνοδεύεται από αυτόματο πρόγραμμα λειτουργίας για κλινικές εφαρμογές (ανοσοφαινότυπους, δείκτες ενεργοποίησης, μέτρησης άωρων αιμοποιητικών κυττάρων) αλλά και από ειδικό ανοικτό ευέλικτο λογισμικό για ερευνητικά πρωτόκολλα με δυνατότητα βελτίωσης της απεικόνισης ασθενών σημάτων. Όλα τα προγράμματα λειτουργίας του κυτταρομετρητή να είναι πιστοποιημένα για χρήση διαγνωστικών/κλινικών εξετάσεων (CE-IVD marked βάση 98/79/EC).
3. Το λογισμικό πρόγραμμα του αναλυτή να συνοδεύεται από έτοιμα πρωτόκολλα για εφαρμογή σφαιριδομετρίας. Να δοθεί η σχετική βιβλιογραφία του προσφερόμενου αναλυτή.
4. Να μπορεί ο χειριστής να δημιουργεί panel ανάλυσης και να εκτυπώνονται αυτόματα προεπιλεγμένα αποτελέσματα ασθενών ανά panel. Επίσης να υπάρχει η δυνατότητα να εξάγονται αυτόματα σε αρχεία τύπου excel και PDF.
5. Να διαθέτει πλήρες πρόγραμμα ελέγχου ποιότητας αποτελεσμάτων και προτυποποίησης με αναπαράσταση σε διαγράμματα Levey-Jennings παραμέτρων επιλογής του χρήστη.
Μέγιστη τιμή: 150 000 EUR.
8: Πλήρες σύστημα παρασκευαστικής χρωματογραφίας αερίου υπερκρίσιμης θερμοκρασίας SFC για τον καθαρισμό και την ταυτοποίηση μορίων με πιθανή φαρμακευτική δράση
Απαραίτητα τεχνικά χαρακτηριστικά:
8.1. Αντλία – Γενικά
1. Αντλία από ανοξείδωτο ατσάλι βαθμωτής έκλουσης (gradient) δύο (2) διαλυτών κατάλληλη για χρήση με υγρό CO2 σε υπερκρίσιμη θερμοκρασία.
2. H βαθμωτή έκλουση να ελέγχεται σε σταθμικές μονάδες βάρους (gravimetric units) αντί μονάδων όγκου στην κλασική χρωματογραφία, ώστε να επιτυγχάνεται μεγαλύτερη ακρίβεια στη μέτρηση πυκνότητας και συμπιεστότητας του υπεκρίσιμου αερίου.
3. Μέγιστη ροή: 15g/min
4. Εύρος πιέσεων λειτουργίας: 100-200bar. Πίεση αερίου εισόδου: 50bar
8.2. Θερμοστάτης στηλών
1. Θερμοστάτηση από 5οC πάνω από τη θερμοκρασία περιβάλλοντος έως 70οC σε βήματα 0,1οC.
2. Ο θερμοστάτης στηλών να έχει απαραίτητα τη δυνατότητα σύνδεσης στηλών κατάλληλων για χρωματογραφία υπερκρίσιμου αερίου αναλυτικού και παρασκευαστικού τύπου.
3. Δυνατότητα θερμοστάτησης έξι (6) στηλών διαστάσεων 2cm X 25cm ή δέκα (10) στηλών αναλυτικής και ημιπαρασκευστικής χρωματογραφίας.
4. Σταθερότητα θερμοκρασίας 0,1 οC.
5. Ακρίβεια θερμοστάτησης ±0,5 οC.
6. Επαναληψιμότητα θερμοστάτησης 0,1 οC.
7. Να περιλαμβάνει απαραίτητα σύστημα προθέρμανσης του υγρού υπερκρίσιμου CO2 και του οργανικού διαλύτη πριν την είσοδό τους στη στήλη.
8.3. Ανιχνευτής Διάταξης Φωτοδιόδων
Ανιχνευτής με διάταξη διόδων με τα παρακάτω ελάχιστα χαρακτηριστικά:
1. Διαθέτει απαραιτήτως 512 στοιχεία φωτοδιόδους για την ανίχνευση όλου του φάσματος.
Σύγκριση με ανιχνευτές που διαθέτουν 1024 φωτοδιόδους:
Στην περίπτωση αυτή οι ανιχνευτές δεν διαθέτουν μία διάταξη 1024 διόδων σε σειρά, αλλά δύο διατάξεις των 512 διόδων παράλληλα. Αποτέλεσμα είναι η ψηφιακά διακριτική ικανότητα να είναι:
Ψηφιακή διακριτική ικανότητα = Εύρος φάσματος / αριθμός διόδων σε σειρά.
Δηλαδή:
Ψηφιακή διακριτική ικανότητα = 800nm-190nm / 512 = 1,2nm.
2. Μπορεί να ανιχνεύσει τρισδιάστατο φάσμα (χρόνος ανάλυσης, απορρόφηση, μήκος κύματος) σε όλα τα μήκη κύματος (190 έως 800nm).
3. Πλήρης έλεγχος και προγραμματισμός όλων των παραμέτρων του ανιχνευτή από τον Η/Υ και το λογισμικό.
4. Τα δεδομένα δεν έχουν ανάγκη διόρθωσης με φίλτρα θορύβου ή αλγόριθμους διόρθωσης γιατί ο ανιχνευτής χρησιμοποιεί αυτόματα τον χρόνο έκθεσης των φωτοδιόδων για να επιτύχει τον καλύτερο λόγο σήματος προς θόρυβο. Έτσι στο φάσμα του βενζολίου διακρίνονται καθαρά οι πέντε κύριες κορυφές.
5. Έχει ως πηγή φωτός προευθυγραμμισμένη λυχνία δευτερίου. Ο προσφερόμενος ανιχνευτής να έχει τη δυνατότητα διατήρησης της ευαισθησίας και της γραμμικότητας της λάμπας UV με τη γήρανση. Να διαθέτει ενσωματωμένο λογισμικό για την διατήρηση της ευαισθησίας και της γραμμικότητας με την γήρανση της λυχνίας UV, χωρίς μεταβολή του εύρους θύρας (slit width), με αποτέλεσμα τη δυνατότητα χρήσης βιβλιοθηκών φασμάτων καθ’ όλη τη διάρκεια ζωής της λυχνίας UV χωρίς απώλεια ευαισθησίας.
6. Να έχει ακρίβεια μήκους κύματος (wavelength accuracy): +1nm.
7. Θόρυβος: ±3x10-5 AU.
8. Απόκλιση (Drift) καλύτερη από 1x10-3 AU/h
9. Κυψελίδα συνεχούς ροής με 10mm μήκος οπτικής δέσμης.
10. Να έχει τη δυνατότητα να λαμβάνει φάσματα για την ανωτέρω περιοχή μηκών κύματος (190nm-800nm) και να τα επεξεργάζεται με το λογισμικό εγκατεστημένο στον Η/Υ με τον οποίο συνδέεται το προσφερόμενο σύστημα χρωματογραφίας. Τα αποτελέσματα να λαμβάνοντα σε μορφή τριών διαστάσεων (3D) δηλαδή απορρόφηση – μήκος κύματος – χρόνος. Δυνατότητα λήψης και επεξεργασίας αποτελεσμάτων και σε μορφή δύο διαστάσεων (2D) απορρόφηση – χρόνος για μέχρι οκτώ (8) διαφορετικά μήκη κύματος. Το λογισμικό να μπορεί να κάνει αναγνώριση κορυφής καθώς και ολοκλήρωση και διερεύνηση της καθαρότητας της. Δυνατότητα ποσοτικού προσδιορισμού κάθε συστατικού σε διαφορετικό μήκος κύματος.
11. Να διαθέτει λειτουργίες αυτοδιάγνωσης και ελέγχου του μήκους κύματος από το λογισμικό και ανίχνευσης βλαβών.
12. Δυνατότητα αυτόματης αλλαγής μήκους κύματος, και σαρώσεων δίχως διακοπή της ροής.
13. Ρύθμιση ευαισθησίας στην περιοχή γραμμικότητας 0.0001 – 2.0000ΑUFS (υπό τον έλεγχο του λογισμικού.
14. Δυνατότητα αφαιρέσεως του φάσματος του φέροντος διαλύτη για αυτόματη διόρθωση του baseline.
15. Δυνατότητα χρήσης βιβλιοθήκης φασμάτων για τη ταυτοποίηση φάσματος αγνώστων κορυφών.
16. Ειδική κατασκευή κυψελίδας που να επιτρέπει την αντιστάθμιση της μεταβολής του δείκτη διάθλασης. Όγκος κυψέλης 8μl. Μήκος διαδρομής φωτός στην κυψέλη (path length) 10mm.
17. Λειτουργίες αυτοδιάγνωσης κατά την έναρξη (startup diagnostics).
8.4. Σύστημα επεξεργασίας δεδομένων
1. Το σύστημα επεξεργασίας δεδομένων πρέπει να είναι τελευταίας έκδοσης και να προγραμματίζει και να ελέγχει τη λειτουργία όλων ανεξαιρέτως των τμημάτων του συστήματος, δηλ.: του χρωματογράφου, του φασματογράφου μάζας, εκτυπωτή, κλπ.
2. Περιλαμβάνει Η/Υ, με ένα πληκτρολόγιο και τα εξής τεχνικά χαρακτηριστικά ή καλύτερα: υπολογιστή (PC) Pentium IV, επεξεργαστής 3.2GHZ, μνήμη RAM 1GB, σκληρός δίσκος 200GB, DVD-RW, mouse, πληκτρολόγιο. Έγχρωμη επίπεδη οθόνη 19΄΄, εκτυπωτής HP laser printer, για την παρουσίαση του πλήρους Report της ανάλυσης.
3. Το λογισμικό (software), να λειτουργεί σε πραγματικό περιβάλλον windows, με ικανότητα multi-tasking, με πλήρες σετ εφαρμογών για επεξεργασία δεδομένων φασματοσκοπίας μάζας, χρωματογραφίας, ως και για τη λειτουργία του όλου συστήματος, συνοδευόμενο από εγχειρίδιο χρήσης, πρωτότυπα CD-ROM και άδειες χρήσης.
4. Να είναι εύχρηστο και απλό στη χρήση και να οδηγεί το χρήστη στην εκτέλεση των διαδικασιών που τον ενδιαφέρουν. Να εκτελεί δε με απλό τρόπο επεξεργασία χρωματογραφημάτων, αποθήκευση με συνθήκες ολοκλήρωσης και υπολογισμό παραμέτρων απόδοσης της μεθόδου.
5. Δυνατότητα εκτέλεσης / απεικόνισης πολλών διεργασιών ταυτόχρονα. Ικανότητα μαθηματικών και στατιστικών υπολογισμών και συγκριτική μελέτη ομάδας χρωματογραφημάτων. Μελέτη των αποτελεσμάτων σύμφωνα με GLP. Δυνατότητα ποσοτικής ανάλυσης για κάθε συστατικό και αποθήκευσης αντιγράφων ασφαλείας μεθόδων και CD-ROM. Να διαθέτει πρόγραμμα αναζήτησης φασμάτων μέσω βιβλιοθηκών.
6. Να μπορεί απαραίτητα να δεχθεί μελλοντικά λογισμικό για την ταυτοποίηση μεταβολιτών με αυτοματοποιημένο τρόπο.
7. Να έχει τη δυνατότητα ελέγχου συστημάτων υγρής χρωματογραφίας και άλλων κατασκευαστών
8. Να παρέχει τη δυνατότητα δημιουργίας χρηστών και ιεραρχικών δικαιωμάτων για λόγους GLP. Περιλαμβάνει δε ειδικά παράθυρα και ενσωματωμένα τεστ και οθόνες βαθμονόμησης του οργάνου για λειτουργία του συστήματος σύμφωνα με GLP.
9. Δυνατότητα μεμακρυσμένης διασύνδεσης κέντρο του προμηθευτή για αποστολή τυχόν τεχνικών προβλημάτων με αυτόματο τρόπο
10. Πρέπει απαραίτητα να περιλαμβάνει δυνατότητα παρακολούθησης των παραμέτρων της ανάλυσης και κυρίως του λόγου των ιόντων σε φάσματα διπλής μάζας MS/MS. Απαραίτητη και η δυνατότητα παρακολούθησης των παραπάνω παραμέτρων για πολυδύναμες μεθόδους προσδιορισμού ταυτόχρονα και της παραγωγής συνολικής έκθεσης (report) στο τέλος της ανάλυσης.
11. Θα πρέπει να έχει τη δυνατότητα λήψης φασμάτων με τρόπο multi channel analysis (MCA, profile) data mode, σε μορφή continuum (profile) και centroid (stick).
12. Θα πρέπει να έχει τη δυνατότητα λήψης φασμάτων και τους εξής τρόπους:
1. MS scanning using quadrupole analyser MS1,
2. MS selected ion recording (SIR),
3. MS – MS product scanning (daughter),
4. MS – MS precursor scanning (parent),
5. MS – MS neutral loss and neutral gain scanning,
6. MS – MS multiple reaction monitoring (MRM),
8.5. Ειδικές απαιτήσεις λογισμικού.
1. Λογισμικό ποσοτικής ανάλυσης:
— Πρέπει να έχει τη δυνατότητα ποσοτικής ανάλυσης δεδομένων GC-MS και GC-MS/MS καθώς και με τις λειτουργίες full scan, SIR/SIM και MRM,
— Αυτοματοποιημένες λειτουργίες συλλογής δεδομένων, ολοκλήρωσης κορυφών, βαθμονόμησης, ποσοτικοποίησης, και υπολογισμοί ελέγχου ποιότητας που να λειτουργούν και σε περιπτώσεις ομαδοποιημένων δειγμάτων,
— Οι παράμετροι του ποσοτικού προσδιορισμού θα πρέπει να αποθηκεύονται για κάθε δραστική χωριστά,
— Θα πρέπει απαραίτητα η συλλογή δεδομένων ανάλυσης δειγμάτων και οι υπολογισμοί ποσοτικής ανάλυσης να γίνονται ταυτόχρονα και από την ίδια πλατφόρμα λογισμικού (interface) για την αποφυγή ασυμβατοτήτων,
— Η έκθεση των αποτελεσμάτων (report) θα πρέπει να μπορεί να εξαχθεί και σε μορφές που είναι συμβατά με άλλα προγράμματα, ενώ πρέπει να μπορεί να αποθηκεύεται και να επανεπεργάζεται ανεξάρτητα των πειραματικών δεδομένων.
2. Αυτόματη συλλογή κλασμάτων.
— Το λογισμικό αυτόματης συλλογής κλασμάτων θα πρέπει να παρέχει πλήρη αυτοματισμό ολόκληρου του κύκλου ανάλυσης, από την εκτίμηση και τη θέση κατωφλίων συλλογής έως και τον καθαρισμό και την ανάλυση κλασμάτων,
— Να περιλαμβάνεται στο λογισμικό δυνατότητα φιλτραρίσματος των μεθόδων έτσι ώστε ο χρήστης να εντοπίζει συγκεκριμένη μέθοδο με βάση τις παραμέτρους της με ευκολία,
— Αυτόματη δημιουργία βαθμωτής έκλουσης (gradients) χωρίς να χρειάζεται η ρύθμιση διαλυτών έκπλυσης στηλών και συστήματος,
— Σύστημα εποπτείας διαλυτών που να εξασφαλίζει τη χρήση πολλαπλών δοχείων με αυτόματα μηνύματα προειδοποίησης σχετικά με την κατάσταση του συστήματος με τη δυνατότητα έξυπνης απενεργοποίησης (intelligent shut-down),
— Σύστημα μεμακρυσμένου ελέγχου που παρακολουθεί το όργανο, καθώς και την κατάσταση διαλυτών και δοχείου απόρριψης,
— Το λογισμικό θα πρέπει απαραίτητα να προκαλεί τη συλλογή κλασμάτων από σήματα ανιχνευτών όπως υπεριώδους-ορατού, ψεκασμού σκέδασης φωτός, μάζας, κλπ,
— Δυνατότητες συλλογής κλασμάτων με διατήρηση της διαμόρφωσης πλακών μικροτιτλοδότησης (one-to-one mapping), συλλογής δευτερευόντων κορυφών μικρότερης σημασίας και συλλογής της απόρριψης (waste).
Συνοδευτικά υλικά – γενικοί όροι.
1. Περιλαμβάνονται τρεις (3) στήλες υγρού χρωματογράφου της επιλογής του εργαστηρίου.
2. Όλα τα μέρη του συστήματος συνεργάζονται πλήρως και η ευθύνη λειτουργίας είναι ευθύνη του προμηθευτή. Το σύστημα θα παραδοθεί πλήρες και έτοιμο προς λειτουργία με όλους τους δυνατούς τρόπους λειτουργίας του.
3. Όλα τα μέρη του συστήματος να είναι απαραιτήτως του ιδίου κατασκευαστή.
Ο προμηθευτής διαθέτει οργανωμένο service με εκπαιδευμένο προσωπικό για την εγκατάσταση, εκπαίδευση, συντήρηση και επισκευή του συστήματος. Εγγυάται δε την ύπαρξη ανταλλακτικών για δέκα χρόνια.
4. Εγγύηση καλής λειτουργίας δύο ετών από την ημερομηνία παράδοσης του συστήματος.
5. Το φύλλο συμμόρφωσης απαραίτητα να έχει ακριβώς την ίδια δομή με την τεχνική προδιαγραφή και να απαντά ξεκάθαρα σε μια προς μια απαιτήσεις.
6. Η χρήση του προσφερόμενου συστήματος ή αντίστοιχου από άλλα εργαστήρια να φαίνεται σε συνημμένη λίστα εγκατεστημένων συστημάτων, όπου και θα φαίνεται η εμπειρία του προμηθευτή σε εγκαταστάσεις και υποστήριξη συστημάτων φασματομετρίας μάζας καθώς και απαραίτητα συστημάτων παρασκευαστικής χρωματογραφίας μεγάλων ροών.
Μέγιστη τιμή: 94 000 EUR.
9: Φυγοκεντρικός συμπυκνωτής υψηλής απόδοσης
Τεχνικές προδιαγραφές.
— Φυγοκεντρικός συμπυκνωτής υψηλής απόδοσης, κατάλληλος για εξάτμιση ευρέως φάσματος μιγμάτων ή μεμονωμένων οργανικών διαλυτών (π.χ. DMSO, TFA) σε θερμοκρασίες <40οC και πιέσεις <0,5mbar,
— Στιβαρή κατασκευή με τον εσωτερικό θάλαμο εξάτμισης από ανοξείδωτο ατσάλι επικαλυμμένο με PTFE,
— Μέγιστη φυγόκεντρος δύναμη: 500 x G,
— Μέγιστο δυνατό φορτίο ανά υποδοχέα: 1,5 kg,
— Μέγιστο δυνατό φορτίο συστήματος: 6 kg,
— Διαθέτει κεφαλή 4 υποδοχέων δειγμάτων,
— Διαθέτει σύστημα ελέγχου μη ισοζυγισμένων δειγμάτων, με μέγιστη αποδεκτή απόκλιση βάρους τα 85 g,
— Μέγιστη ταχύτητα περιστροφής: 1.300 rpm,
— Διαθέτει ενσωματωμένο συμπυκνωτή, χωρητικότητας 2,3 L,
— Κατώτερη/μέγιστη θερμοκρασία συμπυκνωτή: -50 οC+60 οC,
— Διαθέτει αντλία έλικας υψηλής απόδοσης μέγιστου κενού 0.15 mbar χωρίς την ανάγκη αλλαγής-προσθήκης λαδιού,
— Διαθέτει αυτόματο σύστημα ελέγχου της πίεσης θαλάμου και θερμοκρασίας συμπυκνωτή ώστε η θερμοκρασία του συμπυκνωτή να καθορίζεται από το σημείο βρασμού του διαλύτη με σκοπό τη βελτιστοποίηση της εξάτμισης,
— Η προθέρμανση του θαλάμου γίνεται με τη βοήθεια δύο (2) λαμπτήρων υπέρυθρης ακτινοβολίας,
— Διαθέτει σύστημα ελέγχου της θερμοκρασίας του δείγματος αλλά και του υποδοχέα με τη βοήθεια κατάλληλων αισθητήρων προς επιβεβαίωση του τέλους της εξάτμισης αλλά και προς αποφυγή υπερθέρμανσης του ξηρού δείγματος,
— Διαθέτει σύστημα αυτόματου ξεπαγώματος και αποστράγγισης του κάδου του συμπυκνωτή κατά τη διάρκεια ή στο τέλος της μεθόδου, χωρίς να είναι απαραίτητη η παρεμβολή του χρήστη,
— Πραγματική θερμοκρασία εξάτμισης: ± 2,5 οC, της θερμοκρασίας του υποδοχέα,
— Αυτόνομη λειτουργία χωρίς την ανάγκη επιτήρησης. Διακοπή λειτουργίας μετά το τέλος της εξάτμισης ή επί ξηρού,
— Διαθέτει σύστημα αποφυγής υπερχύλισης και επακόλουθης επιμόλυνσης των δειγμάτων,
— Διαθέτει ενσωματωμένο λογισμικό το οποίο περιλαμβάνει 10 προγραμματισμένες μεθόδους εξάτμισης, αυτόματη συλλογή δεδομένων, αλλαγή παραμέτρων οποιαδήποτε στιγμή, προστατευμένες με κωδικό μεθόδους, δυνατότητα συγχώνευσης 2 ή περισσοτέρων μεθόδων, δυνατότητα αποθήκευσης επιπλέον 100 μεθόδων,
— Διαθέτει οθόνη LCD παρατήρησης των παραμέτρων λειτουργίας καθώς και της γραφικής απεικόνισης της πίεσης & θερμοκρασίας,
— Το σύστημα περιλαμβάνει τους ακόλουθους υποδοχείς.
2 τεμ. για μικροπλάκες 96 θέσεων.
2 τεμ. για σωληνάρια HPLC μικρού όγκου
2 τεμ. για σωληνάρια HPLC μεγαλύτερου όγκου.
4 τεμ. για περιέκτες πενικιλίνης με τους αντίστοιχους συνδέσμους στο σύστημα.
2 τεμ. για σωληνάρια ependorf 1.5 ml.
4 τεμ. για δοκιμαστικούς σωλήνες διαφόρων όγκων.
2 τεμ. για σφαιρικές φιάλες 100 ml
2 τεμ. για σφαιρικές φιάλες 250 ml
Μέγιστη τιμή 86.000€.